TVアニメシリーズのキャラクターも多数登場し、新たなオリジナルキャラクターでのシナリオも用意されている。ミッションモードでは、プレイヤーは共和国側か帝国側を選択し、ストーリー仕立てのミッションをクリアしていく。バトルフィールドには市街地や砂漠など、さまざまなシチュエーションが用意されているので、地形や敵によってゾイドのカスタマイズや戦い方を変えていく必要がある。ゾイドバトルモードでは、TVアニメに登場するバンやピットとなり、好きなゾイドで戦うことができる。必殺技を出すシーンでの決めセリフなどもバトルを盛り上げている。
カスタマイズできるゾイドのパターンは100種類以上と多種多彩。ゾイドパイロットとしてバトルスタイルを確立させ、敵を撃破しよう。(樋口浩二)