『ガメラ』『ガメラ2』と3部作をなす平成ガメラ・シリーズ第3作。第1作に登場したギャオスが再登場するほか、親を殺されガメラを憎む少女が育ててしまう邪神イリスが京都に襲来し、神社仏閣や落成間もない京都駅ビルを破壊しつつガメラと戦うクライマックスが最高の見どころ。
   新たに造型されたガメラのスーツは、樋口真嗣特技監督の「耐えているような顔で」とのオファーにより、頭部も小さくシリーズ中最もシャープな印象を残している。対するイリスも鋭角的なフォルムと神々しささえ感じさせる高貴な雰囲気がマッチし、邪神の名にふさわしい敵怪獣となった。
   ストーリー的には第1作の続編的な位置づけであり、第1作でギャオスの謎を追った鳥類学者・長峰真弓（中山忍）が再び怪獣討伐のために奔走するほか、ガメラの巫女的存在の少女・浅黄（藤谷文子）も1、2作に続いて登場。ガメラと心を通わせることが出来る彼女とガメラを憎む少女・綾奈（前田愛）は、いわばポジとネガ、合わせ鏡のような存在。
   前2作製作時より格段に進化したデジタル技術によって、さらに迫力ある映像が創られた。とりわけ前半、渋谷でのガメラ対ギャオスの戦いと、それに巻き込まれる人たちのカタストロフ描写は壮絶にして強烈。（斉藤守彦）