幕末の京都。新撰組隊士・馬庭実行は、池田屋事件の中、捕えられた外国人宣教師オードル・ヘボンの始末を命じられるが・・・。日本とユダヤを結ぶ接点とは？　人類を滅亡へと導く「ハルマゲドン」の秘密とは？　数々の謎が解き明かされる！？収録作「序章　幕末の方舟1～11」の全11話を収録。