ずっと２人で生きてきた長谷川現と夢。過酷な現実の中でも支えあい続けてきた兄妹は、未知のウィルス「pupa」によって更なる絶望に堕ちていく。感染した人間を醜い怪物に変えてしまうpupaウィルスに侵された夢の怪物化を止めるため、現は自分の身体を妹の生き餌として一生捧げ続けることを決断する…。そして、pupaウィルスの秘密を求める謎の集団によって監禁される現と夢。モルモットとして解剖され身体を陵辱される現は最愛の妹を守るため、自分の中に眠っていた「もう1人の現」を目醒めさてしまう…。同じ頃、謎の少年の手引きで監禁場所から逃げ出した夢。なんとか兄との再会を果たそうとするが、抗pupaウィルスの効果は刻一刻と無くなり始めていた…。