宇宙世紀0079年、一年戦争終盤の物語。
実戦データを収集するためのMS実験部隊――第11独立機械化混成部隊通称モルモット隊に配属されたユウ・カジマは、ある任務でブルーディスティニー１号機と遭遇し、
圧倒的なその機体の力に魅了されてしまっていた。
だが、１号機の行方は知れないまま、ユウたちは新たなデータ収集の任務に駆り出される。
一方、もうひとつのEXAM機イフリート改を駆るニムバス・シュターゼンは部下とともに、１号機を狙って急襲を仕掛ける。
ついにユウとニムバス直接対決！
EXAMの共鳴が、戦場に鳴り響く!!