主人公がポケモンの子どもになってしまったところから、冒険が始まる。

パートナーと出会い、いっしょにさまざまなダンジョンを巡り、世界を旅する中でどんな友情をはぐくんでいくのか。

世界の至るところに存在している「不思議のダンジョン」。一度冒険をしたダンジョンでも、改めて挑戦したときには、まったく別の形となっている。

これまでに発見されている全720種類のポケモンがすべて登場。 主人公やパートナーのポケモン以外にも、伝説・幻のポケモンたちが大活躍。

世界中を巡ることを夢見る子どもだった主人公とパートナーが、どのように成長していくのか?『ポケモン超不思議のダンジョン』で繰り広げられる、かつてないスケールの物語!