母に先立たれた高校生・藤井有栖は、彼女を引き取った叔父による家庭内暴力と、学校でのいじめにより精神的に悩まされていた。しかしある日、殺し屋・蜘蛛が来訪し叔父を殺害。それにより、彼女の日常が急変する。 蜘蛛は有栖が自分と同じ先天性集中力過剰 (CEC) の持ち主である事を見抜き、肉親を殺されて居場所を失った彼女を自分たち殺し屋の「裏社会」へと招き入れる。有栖は、ほどなくして恩人である蜘蛛を倒すという試練を乗り越えたが、己の名前を捨てることを拒み、「組織」への加入を拒否。 これにより次々と差し向けられる「組織」の刺客から、自分の日常を守るために戦うことになる。