さまざまな時代にタイムスリップしてきた香里、拓哉、亮平の3人はまたもや時空を超えて、幕末の土佐へ。少年時代の坂本龍馬と出会った彼らは、さらに薩長同盟当夜の京都へとタイムスリップしてしまう！日本史最大の謎のひとつ、龍馬暗殺の犯人は誰なのか？そしてなぜ3人はいとも簡単に時を超えてしまうのか？事件に巻き込まれるうちに、いくつかの謎がいよいよ解き明かされていく！