航海から帰ってまた一文なしになったドリトル先生と動物たち．ついにみんなでサーカス団に入ることにしますが，サーカスの動物たちのひどい暮しに大憤慨．あわれなオットセイ脱出のために，先生の大冒険がはじまります．やがてだんまり芝居で大成功した先生は，悪い団長に代わってサーカスを率いることになりますが…．