LEGOマーヴルスーパーヒーローズは、すべてのマーベルファミリを横断オリジナルストーリーを提供しています。それらはロキと、彼らは地球を制御するために使うことができスーパー武器を組み立てるから、他のマーベル悪役のホストを停止しようとするプレイヤーはアイアンマン、スパイダーマン、ハルク、キャプテンアメリカ、ウルヴァリンと、より多くのマーベルキャラクターの制御を取る。プレイヤーは、彼らがLEGOニューヨーク渡って旅するようなコミックレンガを追いかけるなどスタークタワー、小惑星M、放棄ハイドラベースとX-マンションなどのマーベル·ユニバースからの主要な場所を訪問する。