【目次】
本抄の背景・大意
大段第一　一念三千の典拠を示す
第1章　「摩訶止観」の第5巻の文
第2章　「摩訶止観」の前の4巻などには一念三千は明かされていない
第3章　一念三千は前代未聞の優れた教え
第4章　一念三千は有情と非情にわたる

大段第二(1)観心を明かす
第5章　観心の意味
第6章　十界互具の文を引く
第7章　難信難解を示す
第8章　自身の心に具わる六道
第9章　自身の心に具わる三乗
第10章 凡夫の心に具わる仏界
第11章 教主に関して尋ねる
第12章 経典・論書に関して尋ねる
第13章 経典・論書に関する難問に答える
第14章 教主の難問に答えるに当たり、まず難信難解を示す
第15章 教主に関する難問に答える
第16章 受持即観心を明かす

大段第二(2)本尊を明かす
第17章 権経・法華経迹門の国土
第18章 本門の国土
第19章 本門の本尊を明かす
第20章 末法に出現する本尊を尋ねる
第21章 一代三段・十巻三段を示す
第22章 迹門熟益三段を示す
第23章 本門脱益三段を示す
第24章 文底下種三段の序分・正宗分を明かす
第25章 法華経で成仏する対象の中心
第26章 本門の序分の文を引く
第27章 本門の正宗分の文を引く
1.寿量品は滅後のための法門
2.流通の人と法を明かす
第28章 本門の流通分の文を引く
1.別付嘱の文を引く
2.総付嘱・クン＜てへんに君＞拾遺嘱を明かす
第29章 地涌の菩薩が出現する時は悪世末法
1.地涌の菩薩が出現する時を明かす
2.正法・像法時代の教・機根・時について検証
3.四菩薩の振る舞い
第30章 仏の予言を明かす
1.地涌の菩薩出現の予言
2.本門の本尊の建立を明かす
3.地涌の菩薩出現の前兆を明かす

大段第三　総結

第31章 総結

観心本尊抄送状