エフィドルグの刺客の潜入を許してしまう航宙艦〈くろべ〉。だが、半舷上陸の〈くろべ〉は乗組員のほとんどが、未だ船に戻れない状態だった。果たしてソフィたちは間に合うのか、由希奈は〈くろべ〉に戻ることができるのか……。