東京湾できわめて珍しいサメが100年ぶりに発見された。そのサメの名は「ゴブリンシャーク」。悪魔のサメと呼ばれるこのサメは、その生態も謎に包まれており、自然な姿が撮影されたことも一度もなかった。そのサメが今も生きる暗黒の世界は東京湾の深海、東京海底谷。最後の秘境とも呼ばれる東京海底谷で見られる珍しい深海の生物を紹介しながら、何故東京湾の深海に幻のサメが生きているのか、その謎を追う。