特殊チームの月光、月輪、名月らの活躍は、当時の子供の心をとらえ、手裏剣や月光のポーズを真似た忍者ごっこが流行。「隠密剣士」により火が付いた“忍者ブーム”は、本作品により決定的なものとなり、当時忍者は、プロ野球選手やカーレーサーと並んで、子供たちの憧れの職業（？）に選ばれるほどの人気となりました。放送開始と共に視聴率は２０％以上に達し、放送４ヶ月目は３６．８％（ニールセン調査）を獲得し、最盛期には４０％以上の人気を博しました。また多数のキャラクター商品も発売され、昭和３９年７月には全国東映系で劇場映画も公開され話題となりました。