VRMMO-RPG「THE NEW GATE」内で、突如500年後の「現実」に飛ばされてしまった最古参プレイヤー・シン。天下五剣の一人、三日月宗近の誘いに応じ再び霊峰フジを訪れたシンは、そこで行方不明となった仲間の捜索を依頼される。気配を頼りに向かったフジの隠しダンジョン、そして北方の特殊ダンジョンでは、瘴気に侵され強大化したモンスターが牙を研いでいた……。かつて死闘を演じた、魂を有する天下の名剣たちを窮地から救うべく、オンラインゲーム最強プレイヤーが地下迷宮に突入する！