第一章　カクレキリシタンとは何か
１　カクレキリシタン研究の足跡
２　「潜伏キリシタン」と「カクレキリシタン」
３　「隠れキリシタン」か「カクレキリシタン」か
４　カクレキリシタンに対するイメージの転換
５　潜伏時代とキリシタン崩れ
６　キリシタンの復活とカクレキリシタンの出現　

第二章　カクレキリシタンの分布
１　潜伏キリシタンの分布　
２　現在のカクレキリシタンの分布　

第三章　生月島のカクレキリシタン
１　生月キリシタンの歴史
２　生月のカクレキリシタン組織
３　生月のオラショオラショの意義
４　生月のカクレキリシタン行事
５　生月カクレキリシタンの神観念

第四章　平戸島のカクレキリシタン
１　平戸キリシタンの歴史
２　平戸カクレキリシタンの分布
３　根獅子のカクレキリシタン
４　飯良のカクレキリシタン
５　草積のカクレキリシタン
６　下中野のカクレキリシタン
７　春日のカクレキリシタン
８　獅子のカクレキリシタン
９　油水・中の原・大久保・中の崎のカクレキリシタン
10　霊山安満岳

第五章　五島のカクレキリシタン
１　外海潜伏キリシタンの五島移住
２　若松町築地・横瀬のカクレキリシタン
３　若松島有福のカクレキリシタン
４　奈留島のカクレキリシタン
５　福江島宮原のカクレキリシタン
６　福江島のその他のカクレキリシタン

第六章　長崎のカクレキリシタン
１　家野町のカクレキリシタン
２　岳路のカクレキリシタン

第七章　外海のカクレキリシタン
１　外海キリシタンの歴史
２　出津のカクレキリシタン
３　黒崎のカクレキリシタン

第八章　カクレキリシタンの解散とその未来
解散後の神様の取り扱い　ほか