組織からの離脱、正義は幻か!?　いずれ幕末と呼ばれることになるのかもしれない日本。暗闘を繰り広げる幕府の幕藩体制維持局と、反幕府組織・評議会。激化する抗争の中で、評議会の秘密を知り、離反した一部の初期養成型サムライガン達は、評議会の作戦を阻止すべく…。